Nach Abitur, technischem Praktikum bei Thyssen und dem Zivildienst in der Altenpflege und im Kinderschutz folgte das Designstudium in München, Schwäbisch Gmünd und Offenbach. 1989 Diplom mit besonderer Auszeichnung und im gleichen Jahr Gewinn des Grand Prix auf der World Design Expo in Nagoya in Japan mit dem Entwurf FCS Future Communication Interface – zusammen mit Tsunemitsu Tanaka.

Aufgrund der engen Zusammenarbeit mit Hartmut Esslinger bei frogdesign in San José sowie Bill Moggridge und Bill Verplank bei IDEO in London und in San Francisco beeinflusst, in den 1990er Jahren verstärkte Konzentration auf die Bereiche Strategic Design, Interaction Design und Transportation Design.

Für das Global Design Headquarter von Siemens bis 1998 weltweite Betreuung von Entwicklungen, Planungen und Umsetzungen für Interface Strategies und Corporate Design sowie Corporate Identity, so zum Beispiel Pavillon der Siemens AG auf der Weltausstellung in Sevilla 1992. Dies führte unter anderem zu einer engen Zusammenarbeit mit Pierre Mendell (Grafiker und Plakatgestalter), Herbert Schultes (Chefdesigner der Siemens AG) und Gunther Standke (Chefarchitekt der Siemens AG und Entwerfer des Museum Angewandte Kunst Frankfurt am Main zusammen mit Richard Meier). Zudem enger Kontakt zu Massimo Vignelli (Vignelli Associates New York). Mitte der 1990er Mitarbeit im Designteam ‚Hochgeschwindigkeitszüge Intercity Express 3 und Intercity T‘ mit dem Schwerpunkt Cockpit Design, Cockpit Design Interface und Passenger Information System. 

1997 Berufung zum Professor für Produktgestaltung und für Kommunikationsgestaltung an die Hochschule für Gestaltung in Schwäbisch Gmünd und dort Studiengangsleitung für Produktgestaltung und Planungsmitglied für die Implementierung von Bachelor- und Masterstudiengängen.

2008 Ruf an die Hochschule für Gestaltung in Offenbach am Main (HfG) für das Lehrgebiet Industrial Design. Von 2009 bis 2010 Prodekan, von 2010 bis 2013 und von 2013 bis 2016 Dekan des Fachbereichs Design. Im November 2019 erneute Wahl zum Dekan für eine dreijährige Amtszeit.

Für die beiden Fachbereiche Design und Kunst der Hochschule für Gestaltung Offenbach am Main entwickelte Frank Zebner 2010 das 10-jährige Austauschprogramm ‚Culture Crossing Media & Design‘ mit Elite-Universitäten in China und Südkorea mit einem Gesamtbudget von mehr als 1,1 Million Euro.

2017 entstand das urban-industrielle Projekt ‚Designpark Offenbach‘; aufgrund der intensiven Bemühungen von Frank Zebner konnte der Weltkonzern Samson AG in Offenbach angesiedelt werden. Der Designpark Offenbach soll bis 2026 einen Cluster für Design Spaces und Activities aufbauen.

Frank Zebner lehrte als Gastprofessor an zahlreichen Hochschulen in Europa und Übersee. Unter anderem als Honorarprofessor an der National Taipei University of Technology in Taiwan und 2016 als Gastprofessor für Mobility Design an der China Central Academy of Arts in Peking. 2017 erfolgte die Ernennung zum Gastprofessor für Industrial Design an die School of Fine Arts der Guangzhou University und am BIT Beijing Institute of Technology.

Als Jury-Mitglied begleitete er Designwettbewerbe wie Design Innovation Award Hangzhou, German Design Award Frankfurt, Red Dot Design Award Essen, if Design Award Hannover oder ZVSHK Produkt Award Potsdam. Zudem war er Gutachter für die Vergabe von Forschungsmitteln der ÖBB Österreichischen Bundesbahn.

2008 Übernahme des ITD Institut für technologieorientierte Designinnovation der HfG von seinem Vorgänger Professor Dieter Mankau und Neugründung als DIT Design Institute of Technology; eine Projektplattform für das von ihm vertretene Lehrgebiet Industrial Design. Das DIT forscht und entwickelt für viele mittlere und große Unternehmen, so etwa für Audi, Bartec, BMW, Bosch, KALDEWEI, Lamy, Linde, Lufthansa, Porsche, Siemens, USM Haller, Lufthansa, Wöhner oder Viessmann. 

Frank Zebner ist Mitglied im VDID Verband Deutscher Industrie Designer sowie internationales Mitglied der IDSA Industrial Designers Society of America und damit auch in der WDO World Design Organization vertreten. Darüberhinaus: Gründungsmitglied der GfDg Gesellschaft für Designgeschichte, Gründungsmitglied und Vorstandsvorsitzender des gemeinnützigen Vereins ‚design inclusion‘.

In München führt er ein eigenes Atelier und war u.a. Chefberater für bulthaup und Oventrop. Weitere Kunden: BMW, Gaggenau, EXPO2000, RWE, Meiko, MINI, mato oder Siemens.